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TRABAJOS CON CONDICIÓN

En ocasiones es necesario enviar un trabajo con condiciones. Por ejemplo, cuando se requiere ejecutar un trabajo después que finalice otro correctamente o ejecutar un trabajo después que otro empiece. En estos casos se utiliza la opción --dependency para especificar la condición.

Suponiendo que se desea que el trabajo 2 comience si el trabajo 1 terminó correctamente, primero se envía el trabajo 1 y se anota el id del mismo.

sbatch job1.sl
submitted job 4305

Posteriormente, en el script del trabajo 2 se indica la condición y el id del trabajo 1 separados por (:)

#SBATCH --dependency=afterok:4305

También puede usarse el comando sbatch:

sbatch --dependency=afterok:4305 job2.sl

La dependencia no está limitada a un solo trabajo, es decir, se pueden poner dependencias con respecto a varios trabajos. Por ejemplo:

#SBATCH --dependency=afterok:4305:4306:4307 job4.sl

Además de afterok existen otras dependencias:

after – después que el trabajo haya terminado (no importa como)

afterany – después que cualquier trabajo haya terminado

afternotok – después que el trabajo haya terminado con fallo.

La lista completa de dependencias se puede ver con el comando:

man sbatch
hpc-script-condicion.txt · Última modificación: 2022/11/29 15:27 por Beatriz Valdés Díaz